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Conclusion et Perspectives
- ASSIRC / D-ASSIRC
- Logiciels disponibles sous Unix (Linux, Solaris)
- Adapté à la recherche de paires de régions présentant une similitude de séquences pour des génomes.
- Améliorations de l'algorithme :
- Prise en compte du voisinage des graines.
- Stratégie de validation.
- SIMCOGEN
- Accessible via une interface web à http://www.simcogen.ens.fr
- Ajout de nouveaux génomes complètement séquencés.
- Localisation des paires de régions similaires d'une manière plus fine.
- Extension de la base à des similitudes entre génomes.
- Mise en place de nouveaux outils de visualisation des résultats.