L’équipe Dyogen a été créée en 2004 au sein du département de biologie de l’Ecole Normale Supérieure grâce à un financement ATIP du CNRS.

Le laboratoire étudie les génomes - en particulier de vertébrés - à travers le prisme de l’évolution grâce à des outils bioinformatiques. Les approches que nous utilisons s’appuient sur des comparaisons de génomes entiers pour identifier l’empreinte d’événements qui ont pu se produire au cours de l’évolution et qui ont pu modifier la structure et l’organisation de ces génomes. Il s’agit par exemple d’événements de réarrangements de génomes, de sélection naturelle, ou de contraintes fonctionnelles.

Concrètement, nous étudions deux problématiques en particulier. La première concerne la reconstruction de génomes ancestraux de vertébrés, mais aussi d’insectes, de plantes et de levures. Nous avons développé pour cela des outils qui s’appuient sur des comparaisons de génomes pour identifier des régions où l’organisation est restée identique au cours de l’évolution. Ces données sont disponibles sur le serveur Genomicus (voir menu "Projets"). La deuxième problématique concerne l’étude de la sélection positive récente dans des lignées de vertébrés très distantes les unes des autres, grâce au polymorphisme que l’on peut identifier entre individus de la même espèce. Historiquement, nous avons également apporté des solutions au problème de l’annotation des gènes dans les génomes eucaryotes, et examiné les signaux de positionnement des nucléosomes au niveau des sites d’initiation de la transcriptions des gènes humains.

Dernière mise à jour : 9 novembre 2009