Interface Pise

PISE : UN ENVIRONNEMENT WEB POUR L’EXECUTION D’APPLICATIONS BIOINFORMATIQUES

Les programmes d’analyse de séquences (comme le blast par exemple) sont des programmes qui s’utilisent sous Unix. Ils se révèlent donc être difficiles à utiliser de par leur paramètres syntaxiques et sémantiques.

Pise a été conçue pour palier à ce problème en ajoutant une interface conviviale à chaque programme. Ce logiciel peut à partir d’une définition abstraite des paramètres d’un programme lui générer un modèle d’interface. En effet, il est possible d’utiliser un modèle car la majorité des programmes se comportent de la même manière : paramètres de ligne de commande, interaction simple avec l’entrée standard, paramètres des fichiers et sortie du programme.

L’interface pise sur le site de l’ENS